Андрей Илларионов (aillarionov) wrote,
Андрей Илларионов
aillarionov

Categories:

Ши Чженли и П.Дасзак: Чтобы инфицировать человека, коронавирусу нужны генетические модификации

Как известно, главный цензор Фейсбука по вопросам коронавирусной пандемии Д.Андерсон в течение двух лет неоднократно работала в Уханьском институте вирусологии и является соавтором работ с Ши Чженли. Например, вот этой статьи:

Обнаружение коронавирусов летучих мышей посредством наблюдения и секвенирования следующего поколения на основе захвата зондов
Discovery of Bat Coronaviruses through Surveillance and Probe Capture-Based Next-Generation Sequencing
Bei Li, Hao-Rui Si, Yan Zhu, Xing-Lou Yang, Danielle E. Anderson, Zheng-Li Shi, Lin-Fa Wang, Peng Zhou
Matthew B. Frieman, Editor
Published online January 29, 2020
https://msphere.asm.org/content/5/1/e00807-19/article-info

Другим активным публичным защитником Ши Чженли, а также версии о естественном происхождении коронавируса SARS-СoV-19 является Питер Дасзак, президент американской организации EcoHealtn Alliance:
Исследования доктора Дасзака сыграли важную роль в выявлении и прогнозировании происхождения и воздействия возникающих заболеваний по всему миру. Это включает в себя выявление происхождения коронавируса SARS от летучих мышей...
Dr. Daszak’s research has been instrumental in identifying and predicting the origins and impact of emerging diseases across the globe. This includes identifying the bat origin of SARS...

П.Дасзак также является соавтором работ совместно с Д.Андерсон. Например, вот этой:
Выделение и полногеномная характеристика вирусов Нипах у летучих мышей в Бангладеш
Isolation and Full-Genome Characterization of Nipah Viruses from Bats, Bangladesh
Danielle E. Anderson,1 Ariful Islam,1 Gary Crameri,1 Shawn Todd, Ausraful Islam, Salah U. Khan, Adam Foord, Mohammed Z. Rahman, Ian H. Mendenhall, Stephen P. Luby, Emily S. Gurley, Peter Daszak, Jonathan H. Epstein,1 Lin-Fa Wang.
January 2019
https://www.researchgate.net/publication/330054457_Isolation_and_Full-Genome_Characterization_of_Nipah_Viruses_from_Bats_Bangladesh

Есть работы, в подготовке которых участвовали все три упомянутых лица  – Ши Чженли, П.Дасзак, Д.Андерсон:
Синдром острой диареи у свиней со смертельным исходом, вызванный HKU2-связанным коронавирусом летучей мыши
Fatal swine acute diarrhea syndrome caused by an HKU2-related coronavirus of bat origin
Peng Zhou, Hang Fan, Tian Lan, Xing-Lou Yang, Wei-Feng Shi, Wei Zhang, Yan Zhu, Ya-Wei Zhang, Qing-Mei Xie, Shailendra Mani, Xiao-Shuang Zheng, Bei Li, Jin-Man Li, Hua Guo, Guang-Qian Pei, Xiao-Ping An, Jun-Wei Chen, Ling Zhou, Kai-Jie Mai, Zi-Xian Wu, Di Li, Danielle E. Anderson, Li-Biao Zhang, Shi-Yue Li, Zhi-Qiang Mi, Tong-Tong He, Feng Cong, Peng-Ju Guo, Ren Huang, Yun Luo, Xiang-Ling Liu, Jing Chen, Yong Huang, Qiang Sun, Xiang-Li-Lan Zhang, Yuan-Yuan Wang, Shao-Zhen Xing, Yan-Shan Chen, Yuan Sun, Juan Li, Peter Daszak, Lin-Fa Wang, Zheng-Li Shi, Yi-Gang Tong & Jing-Yun Ma
Published 04 April 2020

https://www.nature.com/articles/s41586-018-0010-9

Иными словами, Ши Чженли, Питер Дасзак, Даниэль Андерсон – дружный коллектив, члены которого знают друг друга хорошо и давно друг с другом работают.

Например, еще в 2006 году Ши и Дасзак стали соавторами вот этой статьи:
Обзор летучих мышей и атипичной пневмонии
Review of Bats and SARS
Lin-Fa Wang, Zhengli Shi, Shuyi Zhang, Hume Field, Peter Daszak, and Bryan T. Eaton
Emerg Infect Dis. 2006 Dec; 12(12): 1834–1840.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3291347/

Это интересная статья.
Некоторые выдержки из нее заслуживают того, чтобы быть воспроизведенными здесь (вначале – перевод отрывков на русский язык, затем – оригинальные цитаты на английском).

Обзор летучих мышей и атипичной пневмонии,
журнал «Новые инфекционные болезни», декабрь 2006 г.

Из-за внезапного и непредсказуемого характера вспышек атипичной пневмонии, начавшихся в ноябре 2002 года в южной части Китайской Народной Республики, структурированные и надежные эпидемиологические исследования для окончательного отслеживания происхождения SARS-CoV не проводились...

Ретроспективные серологические исследования не выявили признаков серопревалентности к SARS-CoV или родственным вирусам в популяции людей (6)...

Группа в Гонконге (31) обнаружила, что при анализе методом ПЦР 23 (39%) из 59 анальных мазков диких китайских подковоносых мышей (R. sinicus) содержали генетический материал, тесно связанный с SARS-CoV. Они также обнаружили, что до 84% исследованных подковоносых летучих мышей содержали антитела к рекомбинантному белку N SARS-CoV. Предыдущее исследование показало определенный уровень антигенной перекрестной реактивности между SARS-CoV и некоторыми коронавирусами 1-й группы (6), а также то, что недавно у летучих мышей было обнаружено несколько коронавирусов 1-й группы...

Тем не менее относительно высокая серопревалентность и широкое распространение серопозитивных летучих мышей согласуется с серологической картиной, ожидаемой от хозяина естественного резервуара патогена (29)...

Секвенирование генома показало, что организация генома всех SARS-подобных-CoV у летучих мышей практически идентична организации SARS-CoV, выделенных от людей или цивет. Они разделяли общую идентичность последовательности от 88% до 92%...

Кроме того, анализ последовательностей показал наличие гораздо большего генетического разнообразия SARS-подобных-CoV у летучих мышей, чем SARS-CoV у цивет или людей, что подтверждает мнение о том, что SARS-CoV является членом этой новой группы коронавирусов, и что летучие мыши являются естественным резервуаром для этого. Общая идентичность геномной последовательности между SARS-CoV человека и вирусами летучей мыши Rp3 (выделена из R. Pearsoni) и HKU3-1 (выделена из R. sinicus) составила 92% и 88% соответственно. Идентичность последовательности между изолятами летучих мышей Rp3 и HKU3-1 составляет 89%, что указывает на то, что генетическая дивергенция среди изолятов летучих мышей так же велика, как и расхождение между каждым из вирусов летучей мыши и изолятами человека / циветы. Кроме того, филогенетические деревья, основанные на разных белковых последовательностях, отражают разные топологии деревьев, как показано на рисунке (панель B), указывающем на существование нескольких эволюционных путей для разных областей генома...

Появление зоонозных вирусов из резервуара дикой природы требует осуществления 4 событий: 1) межвидового контакта, 2) межвидовой передачи вируса (т.е. распространения), 3) устойчивой передачи и 4) адаптации вируса в пределах распространения (34). Эти 4 переходные события произошли во время вспышек атипичной пневмонии и способствовали быстрому распространению заболевания по всему миру...

Несмотря на то, что данные, полученные до сих пор, не являются окончательными, мы уверенно полагаем, что летучие мыши (в частности, подковоносые) являются, скорее всего, резервуаром-хозяином SARS-CoV. Как указывалось выше, коронавирусы летучих мышей, по-видимому, являются видоспецифичными, а обнаруженные до настоящего времени SARS-подобные-CoV связаны исключительно с подковоносыми летучими мышами. Мы надеемся, что дальнейшие полевые исследования в конечном итоге позволят выявить прямого прародителя SARS-CoV среди 69 различных известных видов подковоносых...

Другой подход к поиску естественного резервуара SARS-CoV состоит в проведении экспериментов по заражению различных видов летучих мышей. Если предположить, что вирусы-предшественники происходят от летучих мышей, велика вероятность того, что вирусы SARS-CoV человека / циветы все еще способны инфицировать исходные виды-резервуары ...

Хотя на данном этапе мы не можем исключить возможности прямой передачи от естественного резервуара-хозяина человеку, молекулярные эпидемиологические исследования (2,10) и исследования взаимодействия рецептора-S с белком (35) показывают, что вирусы-предшественники вряд ли способны заражать людей, и что быстрая вирусная эволюция в промежуточном хозяине (таком, как циветы), по-видимому, необходима для адаптации вируса к инфицированию человека. Способность эффективно использовать рецепторные молекулы (ACE2 для человека и циветы), по-видимому, является основным ограничивающим фактором для передачи от животного к человеку и от человека к человеку (35). Это также объясняет, почему SARS-CoV был способен вызывать пандемию у людей, а очень близкие к SARS-like-CoV летучих мышей – нет. Чтобы SARS-подобные-CoV коронавирусы могли инфицировать людей, потребуются существенные генетические изменения в домене, связывающем рецептор S1. Эти изменения могут быть достигнуты одним из двух возможных способов. Они могут быть достигнуты путем генетической рекомбинации, поскольку известно, что коронавирусы способны рекомбинировать. Например, SARS-подобные-CoVs у летучих мышей и другой, еще неизвестный коронавирус, могут коинфицировать промежуточного хозяина, а вирусы у летучих мышей получат место связывания ACE2 в домене S1 путем рекомбинации. Альтернатива – непрерывная эволюция, независимая от рекомбинации. Коронавирусы у летучих мышей могут иметь спектр, достаточно разнообразный, чтобы охватить вирус-предшественник для SARS-CoV. Способность вируса-предшественника связывать человеческий ACE2 может быть приобретена или улучшена путем адаптации (то есть точечных мутаций) в более чем одном промежуточном хозяине, прежде чем он сможет эффективно инфицировать людей. Существование по крайней мере 3 прерывистых высоко вариабельных геномных областей между SARS-CoV и SARS-like-CoV указывает на то, что второй механизм более вероятен.

В заключение следует сказать, что открытие SARS-подобных-CoV у летучих мышей и большое генетическое разнообразие коронавирусов у летучих мышей пролило новый свет на происхождение и передачу SARS-CoV. Хотя точный естественный резервуар хозяина для вируса-предшественника SARS-CoV до сих пор неизвестен, мы считаем, что продолжающийся поиск в различных популяциях летучих мышей в Китайской Народной Республике и соседних странах в сочетании с экспериментальным заражением различных видов летучих мышей SARS-CoV, сможет в конечном итоге определить виды из местного резервуара. Положительный результат этих исследований значительно улучшит наше понимание механизмов распространения, что, в свою очередь, облегчит разработку и реализацию эффективных стратегий профилактики. Обнаружение SARS-подобных CoVs у летучих мышей подчеркивает растущую важность летучих мышей как резервуаров появляющихся вирусов (36). Более того, недавнее появление SARS-CoVs и других ассоциированных с ним летучих мышей, таких как вирусы хенипавирусов (37,38), вирусов Menangle и Tioman (36), а также разновидностей вирусов бешенства и лизсавирусов летучих мышей (38,39) также поддерживает утверждение о том, что вирусы, особенно РНК-вирусы, имеют более высокий риск вызывания заболеваний у людей и домашних млекопитающих, чем другие патогены, из-за их более высокой частоты мутаций (40).

Выражение признательности
Работа, проводимая нашей многонациональной совместной командой, была профинансирована за счет специального гранта для животных резервуаров SARS-CoV, гранта Государственной ключевой программы фундаментальных исследований №. 2005CB523004, гранта Государственной программы развития высоких технологий №. 2005AA219070 от Министерства науки и технологий Китайской Народной Республики; специального фонда президента Академии наук Китая (№ 1009); Шестой рамочной программы EPISARS Европейской комиссии (№ 51163); Австралийского совместного исследовательского центра биобезопасности для новых инфекционных заболеваний (проект 1.007R); гранта Национального института здравоохранения – Национального научного фонда «Экология инфекционных заболеваний» (№ R01-TW05869) Международного центра Джона Э. Фогарти; и гранта Консорциума по консервативной медицине Фонда В. Канна Расмуссена.

Оригиналы цитат на английском:
Because of the sudden and unpredictable nature of the SARS outbreaks that started in November 2002 in southern People's Republic of China, structured and reliable epidemiologic studies to conclusively trace the origin of SARS-CoV were not conducted...

Retrospective serologic studies found no evidence of seroprevalence to SARS-CoV or related viruses in the human population (6)...

A group in Hong Kong (31) found that, when analyzed by PCR, 23 (39%) of 59 anal swabs of wild Chinese horseshoe bats (R. sinicus) contained genetic material closely related to SARS-CoV. They also found that as many as 84% of the horseshoe bats examined contained antibodies to a recombinant N protein of SARS-CoV. A previous study indicated a certain level of antigenic cross-reactivity between SARS-CoV and some group 1 coronaviruses (6) and that several group 1 coronaviruses had recently been found in bats...

Nevertheless, the relatively high seroprevalence and wide distribution of seropositive bats is consistent with the serologic pattern expected from a pathogen's natural reservoir host (29)...

Genome sequencing showed that the genome organization of all bat SARS-like–CoVs is almost identical to that of the SARS-CoVs isolated from humans or civets. They shared an overall sequence identity of 88% to 92%...

Furthermore, sequence analyses indicated the existence of a much greater genetic diversity of SARS-like–CoVs in bats than of SARS-CoVs in civets or humans, which supports the notion that SARS-CoV is a member of this novel coronavirus group and that bats are a natural reservoir for it. The overall genome sequence identities between the human/civit SARS-CoVs and the bat viruses Rp3 (isolated from R. pearsoni) and HKU3–1 (isolated from R. sinicus) were 92% and 88%, respectively. The sequence identity between the bat isolates Rp3 and HKU3–1 is 89%, which indicates that the genetic divergence among the bat isolates is as great as the divergence between each of the bat viruses and the human/civet isolates. In addition, phylogenetic trees based on different protein sequences display different tree topologies, as shown in the Figure (panel B), which indicates the existence of multiple evolutionary pathways for different regions of the genome...

Emergence of zoonotic viruses from a wildlife reservoir requires 4 events: 1) interspecies contact, 2) cross-species virus transmission (i.e., spillover), 3) sustained transmission, and 4) virus adaptation within the spillover species (34). These 4 transition events occurred during the SARS outbreaks and contributed to the rapid spread of the disease around the world...

Although not conclusive, the data obtained so far strongly suggest that bats (horseshoe bats in particular) are most likely the reservoir host of SARS-CoV. As indicated above, bat coronaviruses seem to be species-specific and SARS-like–CoVs discovered so far are exclusively associated with horseshoe bats. We hope that continued field study will eventually identify the direct progenitor of SARS-CoV among the 69 different known horseshoe species...
Another approach to search for the natural reservoir of SARS-CoV is to conduct infection experiments in different bat species. If we assume that the progenitor viruses come from bats, chances are high that the human/civet SARS-CoVs are still capable of infecting the original reservoir species...

Although at this stage we cannot rule out the possibility of direct transmission from the natural reservoir host to humans, molecular epidemiologic studies (2,10) and studies of the receptor-S protein interaction (35) indicate that the progenitor viruses are unlikely to be able to infect humans and that a rapid viral evolution in an intermediate host (such as civets) seems to be necessary to adapt the virus for human infection. Ability to efficiently use the receptor molecules (ACE2 for human and civet) seems to be a major limiting factor for animal-to-human and human-to-human transmission (35). This also explains why the SARS-CoV was able to cause the human pandemic but the closely related bat SARS-like–CoVs were not. For the SARS-like–CoVs to infect humans, substantial genetic changes in the S1 receptor-binding domain will be necessary. These changes may be achieved in 1 of 2 possible ways. They could be achieved by genetic recombination, as coronaviruses are known to be able to recombine. For example, bat SARS-like–CoVs and another yet unknown coronavirus could coinfect an intermediate host, and the bat viruses would gain the ACE2 binding site in the S1 domain by recombination. The alternative is continuous evolution independent of recombination. Coronaviruses in bats could have a spectrum sufficiently diverse to encompass the progenitor virus for SARS-CoVs. The progenitor virus's ability to bind human ACE2 may be acquired or improved by adaptation (i.e., point mutations) in >1 intermediate host before it could efficiently infect humans. The existence of at least 3 discontinuous highly variable genomic regions between SARS-CoV and SARS-like–CoV indicates that the second mechanism is more likely.

In conclusion, the discovery of bat SARS-like–CoVs and the great genetic diversity of coronaviruses in bats have shed new light on the origin and transmission of SARS-CoV. Although the exact natural reservoir host for the progenitor virus of SARS-CoV is still unknown, we believe that a continued search in different bat populations in People's Republic of China and neighboring countries, combined with experimental infection of different bat species with SARS-CoV, will eventually identify the native reservoir species. A positive outcome of these investigations will greatly enhance our understanding of spillover mechanisms, which will in turn facilitate development and implementation of effective prevention strategies. The discovery of SARS-like–CoVs in bats highlights the increasingly recognized importance of bats as reservoirs of emerging viruses (36). Moreover, the recent emergence of SARS-CoVs and other bat-associated viruses such as henipaviruses (37,38), Menangle, and Tioman viruses (36), and variants of rabies viruses and bat lyssaviruses (38,39) also supports the contention that viruses, especially RNA viruses, possess more risk than other pathogens for disease emergence in human and domestic mammals because of their higher mutation rates (40).

Acknowledgments
The work conducted by our multination collaborative team was jointly funded by a special grant for Animal Reservoirs of SARS-CoV, State Key Program for Basic Research grant no. 2005CB523004, and State High Technology Development Program grant no. 2005AA219070 from the Ministry of Science and Technology, People's Republic of China; a special fund from the president of the Chinese Academy of Sciences (no. 1009); the Sixth Framework Program, EPISARS, from the European Commission (no. 51163); the Australian Biosecurity Cooperative Research Centre for Emerging Infectious Diseases (Project 1.007R); an National Institutes of Health-National Science Foundation Ecology of Infectious Diseases award (no. R01-TW05869) from the John E. Fogarty International Center; and an award to the Consortium for Conservation Medicine from the V. Kann Rasmussen Foundation.

Как видим, в статье немало интересного.
Но внимание читателя привлекает прежде всего следующее утверждение авторов – тех самых, что ныне опровергают синтетическую версию происхождения коронавируса SARS-CoV-19 и настаивающих на версии его естественного происхождения:

Коронавирусы летучих мышей, близкие к SARS-like-CoV,
естественного происхождения не способны вызвать пандемию у людей. Для того, чтобы SARS-подобные-CoVs могли инфицировать людей, требуются существенные генетические изменения в домене, связывающем рецептор S1.

Особую признательность выражаю френдам этого блога onlyfreedigits, scholast, Дайнису Крумсу за помощь в подготовке этого текста.

П.С.
Peter Daszak
@PeterDaszak
Apr 12
Мой коллега и друг Чжэнли Ши. Оскорблена, ей угрожают конспирологи в США и Китае. Находится под давлением ее собственного правительства. Вирусолог мирового класса, первый, кто определил происхождение SARS-CoV-2 и замечательный щедрый человек. Ее следует хвалить как героя, а не поносить.
My colleague & friend Zhengli Shi. Insulted, threatened by conspiracy theorists in US & China. Pressured by her own govt. World class virologist, 1st to identify origin of SARS-CoV-2 & wonderful generous person. She should be lauded as hero, not vilified.
https://twitter.com/PeterDaszak/status/1249136348876943369

Peter Daszak
@PeterDaszak
Apr 12
Чженли провела последние 15 лет, показывая всем нам, что эти вирусы представляют собой явную и существующую опасность. Она была права. Теперь она получает оскорбления и угрозы, политическое давление со всех сторон. Это пародия. Пожалуйста, прочитайте эту петицию и, если вы согласны, подпишите.
Zhengli has spent the last 15 years showing us all that these viruses are a clear & present danger. She was right. Now she's receiving insults & threats, political pressure from all sides. This is a travesty. Please read this petition & if you agree, sign.
https://twitter.com/PeterDaszak/status/1249136348876943369

Петиция в поддержку Ши Чженли на сайте https://www.change.org:

Гранты Ши Чженли в 2020-2023 гг.:
- 01/01/2016-31/12/2020 Geographical distribution and genetic variation of pathogens in Africa, Sino-Africa Joint Research Center, Chinese Academy of Science, project no: SAJC20165. Principal Investigator. 2,400,000 RMB.
- 01/01/2018-31/12/2021 Evolution mechanism of the adation of bat SARS-related coronaviruses to host receptor molecules and the risk of interspecies infection, National Natural Science Foundation of China, project no: 31770175. Principal Investigator. 660,000 RMB.
- 01/07/2018-30/06/2023 Genetic evolution and transmission mechanism of important bat-borne viruses. The strategic Priority research Program of Chinese Academy of Sciences. Principal Investigator. 8,750,000 RMB.
- 01/01/2019-31/12/2023 Pathogen biology studies on novel swine coronavirus, National Natural Science Foundation of China, project no: 31830096. Principal Investigator. 3,480,000 RMB.
https://www.ws-virology.org/wp-content/uploads/2017/11/CV_SHI-ZL-2018_ASM.pdf

Tags: Китай, США, биология, здоровье, люди, мафия, эпидемии
Subscribe
  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 244 comments
Previous
← Ctrl ← Alt
Next
Ctrl → Alt →
Previous
← Ctrl ← Alt
Next
Ctrl → Alt →