Андрей Илларионов (aillarionov) wrote,
Андрей Илларионов
aillarionov

Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV. Запрещенная статья китайских ученых

6 февраля 2020 г. исследователи Ботао Сяо из Объединенной международной исследовательской лаборатории синтетической биологии и медицины Южно-Китайского технологического университета в Гуанчжоу и Лэй Сяо из Уханьского университета науки и технологии опубликовали статью о возможном происхождении нового коронавируса.
На следующий день статья была снята с веб-сайта.
Статья не понравилась многим как в КНР, так и в ВОЗ, а также на CNN, BBC, в Нью-Йорк Таймс.

Досье Пяти глаз комментирует статью следующим образом:
Исследователи из Южно-Китайского технологического университета 6 февраля опубликовали статью, в которой сделали вывод, что «коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Возможно, потребуется усилить уровень безопасности в биологических лабораториях высокого риска». «Статья была вскоре отозвана, поскольку она ‘не была подтверждена прямыми доказательствами’, по словам автора Ботао Сяо», – отмечает досье, напоминая при этом: «Ни один ученый не подтвердил, но и не опроверг выводы статьи, – заметил 5 марта ученый Янчжун Хуан». The Sunday Telegraph не утверждает, что исследование Южно-Китайского технологического университета заслуживает доверия только на основании того, что оно было включено в правительственное досье, подготовленное в рамках дела против Китая.

Ниже следуют перевод на русский язык запрещенной статьи Ботао Сяо и Лэй Сяо и ее англоязычный оригинал.

Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Препринт · Февраль 2020
DOI: 10.13140 / RG.2.2.21799.29601

2 автора, в том числе:
Ботао Сяо, Южно-Китайский технологический университет, 26 публикаций, 265 цитирований

Авторы этой публикации работают также над следующими смежными проектами:
Национальный фонд естественных наук Китая (11372116) Посмотреть проект
Национальный фонд естественных наук Китая (11772133) Посмотреть проект

Все материалы, размещенные на этой странице, были загружены Ботао Сяо 06 февраля 2020 г.

Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Ботао Сяо (1, 2*) и Лэй Сяо (3)
1 Объединенная международная исследовательская лаборатория синтетической биологии и медицины, Школа биологии и биологической инженерии, Южно-Китайский технологический университет, Гуанчжоу 510006, Китай
2 Школа физики, Университет науки и технологии Хуажонг, Ухань 430074, Китай
3 Больница Тянь Ю, Уханьский университет науки и технологии, Ухань 430064, Китай
* Автор-корреспондент: xiaob@scut.edu.cn
Тел / факс: 86-20-3938-0631

К 6 февраля 2020 года коронавирус 2019-nCoV вызвал эпидемию в Китае численностью в 28060 лабораторно подтвержденных инфекций у человека, в том числе 564 смертельных случая. Два описания вируса, опубликованные в Nature на этой неделе, показали, что последовательности генома от пациентов идентичны на 96% или 89% коронавирусу Bat CoV ZC45, первоначально обнаруженному у Rhinolophus affinis (1,2). Крайне важно изучить, откуда появился этот возбудитель, и каким образом он передался человеку.

В статье, опубликованной в The Lancet, сообщалось, что у 41 пациента из Уханя был обнаружен острый респираторный синдром, причем у 27 из них был контакт с рынком морепродуктов Хуанань (3). Вирус 2019-nCoV был обнаружен в 33 из 585 проб, собранных на рынке после вспышки. Рынок стали подозревать в том, что он стал источником эпидемии, и потому он был закрыт в соответствии с карантинными правилами по отношению к источнику во время эпидемии.

Летучие мыши, являющиеся носителями CoV ZC45, были первоначально найдены в провинциях Юньнань или Чжэцзян, каждая из которых находится более чем в 900 километрах от рынка морепродуктов. Обычно летучие мыши живут в пещерах и на деревьях. Но рынок морепродуктов находится в густонаселенном районе Уханя, где проживает около 15 миллионов человек. Вероятность того, что летучие мыши прилетели на рынок, является очень низкой. Согласно муниципальным отчетам и свидетельствам 31 жителя и 28 посетителей рынка, летучие мыши никогда не были источником питания в городе, и на рынке не продавалось ни одной летучей мыши. Естественная рекомбинация или же наличие промежуточного хозяина коронавируса возможны, но для этого пока мало доказательств.

Был ли другой возможный путь? Мы обследовали территорию вокруг рынка морепродуктов и определили две лаборатории, проводящие исследования над коронавирусами летучих мышей. Примерно в 280 метрах от рынка находится Уханьский центр по контролю и профилактике заболеваний (WHCDC) (рис. 1, карты Baidu и Google). WHCDC размещал животных в лабораториях для исследовательских целей, одна из которых специализировалась на сборе и идентификации патогенов (4-6). Для одного из этих исследований 155 летучих мышей, включая Rhinolophus affinis, были отловлены в провинции Хубэй, а другие 450 летучих мышей были выловлены в провинции Чжэцзян (4). Эксперт по отлову мышей отмечен в разделе Авторы (JHT). Кроме того, он выступал в медиа по вопросу о коллекционировании вирусов в общенациональных газетах и ​​на сайтах в 2017 и 2019 годах (7, 8). Он рассказал, что однажды на него напали летучие мыши, и кровь летучей мыши попала ему на кожу. Он знал о чрезвычайной опасности заражения, поэтому он поместил себя в карантин на 14 дней (7). В результате другого инцидента он снова изолировал себя, потому что летучие мыши помочились на него. Однажды он был в полном восторге от того, что смог поймать летучую мышь с живым клещом (8).

На пойманных животных проводились хирургические операции, а образцы их тканей собирались для выделения их ДНК и РНК и секвенирования (4, 5). Образцы тканей и инфицированные отходы являлись источниками патогенов. Они оказались всего примерно в 280 метрах от рынка морепродуктов. WHCDC также находится рядом с Объединенным госпиталем (рис. 1, внизу), где во время этой эпидемии была заражена первая группа врачей. Вполне вероятно, что вирус просочился, и некоторые из врачей заразили первых пациентов этой эпидемии, хотя для будущего исследования необходимы веские доказательства.

Вторая лаборатория находится примерно в 12 км от рынка морепродуктов и принадлежит Уханьскому институту вирусологии Академии наук Китая (1, 9, 10). Эта лаборатория сообщила, что китайские подковоносые летучие мыши являются естественным резервуаром для коронавируса SARS-CoV, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром, приведшего к пандемии 2002-2003 гг. (9). Главный исследователь этой лаборатории участвовала в проекте, в котором с помощью обратного генетического подхода к SARS-CoV сгенерировала химерный вирус и сообщила о возможности передачи его человеку (10). [Наше] прямое предположение заключается в том, что вирус SARS-CoV или его производный мог выскочить из лаборатории.

Таким образом, кто-то замешан в истории с эволюцией коронавируса 2019-nCoV. В дополнение к версии о происхождении вируса путем естественной рекомбинации с помощью промежуточного хозяина, имеется версия, согласно которой коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Очевидно, в лабораториях с высокой степенью риска потребуется повысить уровень безопасности. Возможно, необходимо будет принять правило по перемещению этих лабораторий подальше от городских центров и других густонаселенных мест.

Авторы
BС разработал план статьи и собрал литературу. Все авторы провели сбор и анализ данных, собрали документы, нарисовали карту и участвовали в написании статьи.

Признание
Эта работа поддерживается Национальным фондом естественных наук Китая (11772133, 11372116).

Декларация интересов
Все авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.

Ссылки
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.


Рисунок 1. Рынок морепродуктов Хуанань находится недалеко от WHCDC (из карт Baidu и Google).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf


The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Preprint · February 2020
DOI: 10.13140/RG.2.2.21799.29601

2 authors, including:
Botao Xiao South China University of Technology 26 PUBLICATIONS   265 CITATIONS

Some of the authors of this publication are also working on these related projects:
National Natural Science Foundation of China (11372116) View project
National Natural Science Foundation of China (11772133) View project

All content following this page was uploaded by Botao Xiao on 06 February 2020

The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Botao Xiao1,2* and Lei Xiao3
1 Joint International Research Laboratory of Synthetic Biology and Medicine, School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China
2 School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China
3 Tian You Hospital, Wuhan University of Science and Technology, Wuhan 430064, China
*Corresponding author: xiaob@scut.edu.cn
Tel / Fax: 86-20-3938-0631

The 2019-nCoV coronavirus has caused an epidemic of 28,060 laboratory-confirmed infections in human including 564 deaths in China by February 6, 2020. Two descriptions of the virus published on Nature this week indicated that the genome sequences from patients were 96% or 89% identical to the Bat CoV ZC45 coronavirus originally found in Rhinolophus affinis 1,2. It was critical to study where the pathogen came from and how it passed onto human.

An article published on The Lancet reported that 41 people in Wuhan were found to have the acute respiratory syndrome and 27 of them had contact with Huanan Seafood Market 3. The 2019-nCoV was found in 33 out of 585 samples collected in the market after the outbreak. The market was suspicious to be the origin of the epidemic, and was shut down according to the rule of quarantine the source during an epidemic.

The bats carrying CoV ZC45 were originally found in Yunnan or Zhejiang province, both of which were more than 900 kilometers away from the seafood market. Bats were normally found to live in caves and trees. But the seafood market is in a densely-populated district of Wuhan, a metropolitan of ~15 million people. The probability was very low for the bats to fly to the market. According to municipal reports and the testimonies of 31 residents and 28 visitors, the bat was never a food source in the city, and no bat was traded in the market. There was possible natural recombination or intermediate host of the coronavirus, yet little proof has been reported.

Was there any other possible pathway? We screened the area around the seafood market and identified two laboratories conducting research on bat coronavirus. Within ~280 meters from the market, there was the Wuhan Center for Disease Control & Prevention (WHCDC) (Figure 1, from Baidu and Google maps). WHCDC hosted animals in laboratories for research purpose, one of which was specialized in pathogens collection and identification 4- 6. In one of their studies, 155 bats including Rhinolophus affinis were captured in Hubei province, and other 450 bats were captured in Zhejiang province 4. The expert in collection was noted in the Author Contributions (JHT). Moreover, he was broadcasted for collecting viruses on nation-wide newspapers and websites in 2017 and 2019 7,8. He described that he was once by attacked by bats and the blood of a bat shot on his skin. He knew the extreme danger of the infection so he quarantined himself for 14 days 7. In another accident, he quarantined himself again because bats peed on him. He was once thrilled for capturing a bat carrying a live tick 8.

Surgery was performed on the caged animals and the tissue samples were collected for DNA and RNA extraction and sequencing 4, 5. The tissue samples and contaminated trashes were source of pathogens. They were only ~280 meters from the seafood market. The WHCDC was also adjacent to the Union Hospital (Figure 1, bottom) where the first group of doctors were infected during this epidemic. It is plausible that the virus leaked around and some of them contaminated the initial patients in this epidemic, though solid proofs are needed in future study.

The second laboratory was ~12 kilometers from the seafood market and belonged to Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences 1, 9, 10. This laboratory reported that the Chinese horseshoe bats were natural reservoirs for the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the 2002-3 pandemic 9. The principle investigator participated in a project which generated a chimeric virus using the SARS-CoV reverse genetics system, and reported the potential for human emergence 10. A direct speculation was that SARS-CoV or its derivative might leak from the laboratory.

In summary, somebody was entangled with the evolution of 2019-nCoV coronavirus. In addition to origins of natural recombination and intermediate host, the killer coronavirus probably originated from a laboratory in Wuhan. Safety level may need to be reinforced in high risk biohazardous laboratories. Regulations may be taken to relocate these laboratories far away from city center and other densely populated places.

Contributors
BX designed the comment and performed literature search. All authors performed data acquisition and analysis, collected documents, draw the figure, and wrote the papers.

Acknowledgements
This work is supported by the National Natural Science Foundation of China (11772133, 11372116).

Declaration of interests
All authors declare no competing interests.

References
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.


Figure 1. The Huanan Seafood Market is close to the WHCDC (from Baidu and Google maps).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf
Tags: Китай, биология, эпидемии
Subscribe
  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 104 comments
Previous
← Ctrl ← Alt
Next
Ctrl → Alt →
Previous
← Ctrl ← Alt
Next
Ctrl → Alt →